Thèse en biologie cellulaire F/H

Nous recrutons un(e) doctorant(e) pour rejoindre le groupe « BPCO » de l'équipe « Remodelage Bronchique », sous la direction du Pr Isabelle Dupin.
Le groupe axé sur la physiopathologie de la BPCO est une équipe jeune et dynamique d'environ 10 personnes (chercheurs·ses/chercheurs·ses-clinicien·nes, doctorant·es, ingénieur·es, technicien·nes). L'objectif général du groupe est de comprendre le développement des maladies respiratoires chroniques à l'aide d'approches interdisciplinaires, en se concentrant sur les interactions entre les cellules et leur microenvironnement. Nous possédons une expertise reconnue en physiologie et physiopathologie pulmonaire et développons des organoïdes modèles en s'appuyant sur des techniques de culture cellulaire et d'imagerie innovantes
Votre mission :
Vous construisez de nouveaux modèles organoïdes des voies respiratoires, en introduisant un compartiment mésenchymateux et en stimulant les voies de morphogenèse. La clairance mucociliaire, la réponse immunitaire innée et la capacité de régénération seront évaluées à l'état basal et après l'exposition aux particules. Ces mesures indirectes de la résilience tissulaire seront liées à l'état de résilience clinique du donneur dont les cellules ont été prélevées.
Plus précisément, vous :
• Réalisez des dissections et procéderez à l'isolation de cellules à partir de tissus humains.
• Mettez en culture des cellules primaires :
en 2D, afin d'obtenir des cellules progénitrices,

en 3D, sous forme d'organoïdes, pour modéliser des structures tissulaires complexes.
• Vous conduirez diverses analyses biologiques, notamment :
l'acquisition d'images par imagerie 3D,

l'analyse de populations cellulaires via la cytométrie en flux,

la détection de marqueurs spécifiques par immunohistochimie et immunocytochimie,
l'étude de l'expression génique et protéique par RT-qPCR et western blot,

l'exploration du contenu protéique grâce à la protéomique,

la caractérisation de l'expression transcriptomique au niveau unicellulaire (single cell).

Vous êtes titulaire d'un diplôme de master 2 ou ingénieur·e dans le domaine de la biologie ?
Vous avez idéalement de l'expérience en culture cellulaire et/ou ingéniérie tissulaire, en cytométrie en flux et en analyse « omics » (non obligatoire mais appréciable) et/ou codage.
Vous maitrisez l'anglais professionnel et avez de bonnes capacités d'analyse de résultats.
Enfin, vous travaillez avec dynamisme, ouverture d'esprit et avec le sens de la communication pour travailler dans un environnement interdisciplinaire.


Plus d'informations :
Basé à Pessac (Hôpital Xavier Arnozan)
Contrat doctoral de 3 ans à partir de septembre 2025
Salaire mensuel brut : 2 200 €


Avantages liés au poste :
• 50 jours de congés annuels dès la première année
• Prise en charge à 75% de l'abonnement aux transports en commun de Gironde
• Participation à la mutuelle à hauteur de 15€ / mois
• Des offres loisirs, sport et culture pour tous les personnels
• Forfait "mobilités durables" sur trajet domicile – travail
• Parcours d'accueil et formations