Chercheur post-doctorat épidémiologie génétique F/H

Dans ce contexte, nous recrutons deux chercheur∙euses post-doctorant en épidémiologie génétique ayant une expérience en biostatistique (ou bioinformatique) pour œuvrer sur le projet de recherche SHIVA (Stopping cognitive decline and dementia by fighting covert vascular brain injury).


Votre mission principale se déclinent en deux axes principaux :
-          La mise en œuvre d'analyses d'association entre des biomarqueurs moléculaires et des phénotypes liés à la maladie des petits vaisseaux cérébraux,
-          Et le développement de méthodologies d'intégration de données multi-omiques afin d'identifier de nouveaux phénotypes moléculaires.

Plus précisément, vos activités se déclineront ainsi :
# Analyse de données
• Vous participez au prétraitement bioinformatique/statistique de données multi-omiques ;
• Vous conduisez l'analyse statistique des données multi-omiques des cohortes du projet SHIVA et dans le cadre de méta-analyses d'autres cohortes internationales ;
• Vous développez des programmes informatiques dédiées à l'analyse de données (gén)omiques.

# Intégration de résultats et valorisation de la recherche
• Vous étudiez la cohérence biologique des résultats statistiques au moyen d'outils bioinformatiques et de différentes bases de données ;
• Vous participez à valoriser les résultats (constitution, organisation, gestion, visualisation) notamment par la rédaction d'articles scientifiques (revues scientifiques haut niveau).



# Encadrement
• Vous participez à la formation et à l'encadrement de stagiaires et doctorants à l'utilisation de logiciels d'analyse de données multi-omiques ;
• Vous communiquez auprès des différents partenaires du projets (nationaux et internationaux) notamment au sein des consortiums CHARGE, ISGC, BRIDGET.



Vous travaillerez sur un serveur de calcul de haute performance et avez de multiples données moléculaires générées par des cohortes de grande dimension ayant également des données épidémiologiques et d'imagerie cérébrale.

Titulaire d'un doctorat (PhD) en épidémiologie génétique, statistique génétique, bioinformatique ou équivalent, vous avez une expérience dans l'analyse statistique et bioinformatique de données génomiques (et méthodologies associées).
• Vous faites preuve d'un bon niveau d'anglais (écrit, parlé et lu) et détenez des compétences en communication (rédactionnelle et orale) ;
• Vous maîtrisez différents langages de programmation (eg R, Python, C, C++, Perl), différents environnements informatiques (LINUX, Windows), l'utilisation de clusters/grilles d'ordinateurs
• Vous savez gérer, organiser et manipuler des données (génomiques) de grandes dimensions en associant les bons outils appropriés aux problèmes posés ;
• Vous maitrisez les outils communs de génétique statistique et bio-informatiques (ex FUSION, GATK, GSEA, GWAMA, LDPRED, MAGMA, Metal, Plink, Regenie, PRScs, R, Regar) ;
• Vous êtes capable de réaliser des études et analyses à partir de données omiques et mettez en œuvre des stratégies d'analyse intégrées multi-omiques.
Une expérience dans l'application de méthodes empruntées au monde l'IA serait un plus.



Plus d'informations  :
En rejoignant le BPH de l'Université de Bordeaux, vous travaillerez dans l'équipe ELEANOR sous la supervision directe de David-Alexandre Tregouët et Stéphanie Debette.
Vous serez en étroite interaction avec les autres équipes du BPH, de l'IHU VHI et du projet SHIVA à Bordeaux.


Basé à Bordeaux (Campus Carreire) - accès tram Hôpital Pellegrin (arrêt de tram) bus, vélo.
Certains déplacements à prévoir (workshop, congrès, etc.)


CDD de 17 mois à partir du 1er novembre 2024


Salaire mensuel brut : entre 2750 et 3000 € selon expérience


Avantages liés au poste  :
50 jours de congés annuels dès la première année
Offre de restauration subventionnée
Télétravail possible selon nécessités et organisation du service
Prise en charge à 75% de l'abonnement aux transports en commun de Gironde
Participation à la mutuelle à hauteur de 15€ / mois
Des offres loisirs, sport et culture pour tous les personnels 
Forfait "mobilités durables" sur trajet domicile – travail
Parcours d'accueil et formations



Processus de recrutement  : après la période de publication de l'annonce, nous prendrons contact avec les candidats retenus pour un entretien organisé avec le(s) manager(s) et le chargé de recrutement.
Pour être complète, votre candidature doit comporter à minima votre CV et une lettre de motivation (2 pages max).