Ingénieur en biologie synthétique et automatisation F/H

Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.

Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s'attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche.

Déployant ses formations auprès de 55 000 étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 IATSS partenaires. Son budget est de plus de 700 M€.

Située au coeur de Paris, elle présente une organisation avec des directions inter-facultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de 27 sites en Ile-de-France et en régions.

Fonctions : Ingénieur-e en biologie synthétique et automatisation
Emploi-type : A1A42 - Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique
Catégorie : A
Corps : IGR
BAP : A

CDD de 2 ans.
A pourvoir à compter de février 2026.

Mission :
L'ingénieur-e de recherche sera chargé-e de concevoir, développer, adapter et expérimenter de nouvelles méthodologies de biologie moléculaire et biologie synthétique pour une biofonderie, une plateforme robotisée de bio-ingénierie. Il/elle devra développer, automatiser et optimiser des méthodes de biologie synthétique appliquées à l'ingénierie automatisée de souches de microorganismes (bactéries et levures principalement). Il/Elle supervisera les projets d'ingénierie et de phénotypage des microorganismes.

Activités principales :

• Concevoir le développement et conduire en spécialiste la mise en place de procédures automatisés pour la modification génétique de microorganismes
• Conseiller les utilisateurs et utilisatrices dans le cadre d'un projet scientifique, évaluer et valider les choix et les options techniques
• Concevoir, développer, mettre en place et conduire en spécialiste l'automatisation des approches de biologie synthétique pour l'ingénierie des bactéries et des levures : utilisation/programmation de robots de transfert de liquide, clonages, automatisation des génotypages, phénotypages simple et repiquages de microorganismes
• Gérer et maintenir les collections de plasmides (briques élémentaires, circuits génétiques) et de souches microbiennes
• Traiter les données (analyser, interpréter et valider les résultats) et en garantir le suivi et la qualité
• Assurer un reporting régulier des projets et communiquer les résultats sous forme de rapports
• Assurer une veille scientifique et technologique dans ses domaines d'activité
• Gérer les moyens techniques et financiers alloués aux activités d'expérimentation
• Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en oeuvre des techniques de l'expérimentation en biologie, encadrement des étudiant-es et utilisateurs-trices
• Appliquer et faire appliquer les règles d'hygiène et de sécurité

Conduite de projets : Oui

Encadrement : Non

Expositions aux risques professionnels : Risque biologique (non pathogène) et chimique associé aux techniques classiques en microbiologie et biologie moléculaire

Connaissances transversales requises :

• Connaissance approfondie des méthodologies de biologie moléculaire et biologie synthétique (clonages Golden Gate, Gibson assembly, CRISPR-Cas9, transgénèse, recombinaison homologue…)
• Excellente maîtrise des concepts de la biologie synthétique et de la bioproduction (cycles DBTL, standardisation, abstraction, automatisation, biofonderie, bioproduction)
• Excellentes connaissance théoriques et pratiques de la culture, de l'ingénierie et du phénotypage des microorganismes
• Connaissances théoriques et pratiques en microbiologie générale
• Connaissances de base en programmation Python
• Connaissance générale des approche d'IA/ML appliquées à l'ingénierie du vivant
• Notions d'informatique appliquée à l'automatisation des transferts de liquide (robots de pipetage/clonage) et à la gestion informatisée de collections (souches, plasmides, briques d'ADN…)
• Réglementation en matière d'Hygiène et de Sécurité
• Cadre légal et déontologique de l'activité
• Réglementation financière (notion de base)
• Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-faire :

• Concevoir en expert de nouvelles techniques de biologie moléculaire et biologie synthétique (clonage haut débit, génotypage, phénotypage)
• Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité (biologie moléculaire, automatisation, gestion de stocks) (par exemple : Genious, SnapGene, Benchling, ELN…)
• Rédiger des documents scientifiques et assurer une gestion des projets scientifiques
• Développer une expertise scientifique et technologique
• Encadrer des étudiants
• Gérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires)

Savoir-être :

• Bon relationnel et sens du travail en équipe
• Sens de l'organisation (expérimentation, gestion des stocks et des commandes)
• Capacité de raisonnement analytique

Diplôme réglementaire souhaité : Doctorat
Domaine de formation souhaité : biologie moléculaire, biotechnologies, microbiologie, biochimie