Biostatisticien F/H

Choisir Sorbonne Université, c’est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d’égalité, d’innovation, de diffusion des savoirs, d’ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.

Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s’attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche.

Déployant ses formations auprès de 55 000 étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 ITA partenaires. Son budget est de plus de 700 M€.

Située au cœur de Paris, elle présente une organisation avec des directions interfacultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de 27 sites en Île-de-France et en régions http://www.sorbonne-universite.fr

Ce poste est à pourvoir au sein de la faculté de santé • https://sante.sorbonne-universite.fr

Sous la tutelle de l’Inserm et de Sorbonne Université, l'Institut Pierre Louis d’Épidémiologie et de Santé Publique (Iplesp), et plus particulièrement l’équipe SUMO (Surveillance et modélisation des maladies transmissibles), développe plusieurs projets permettant de mieux caractériser les maladies transmissibles et leur dissémination dans des populations modernes :

• grâce au réseau Sentinelles, elle produit des statistiques en temps réel sur la dissémination de maladies transmissibles communes ou émergentes en France en population générale, et sur certaines infections surveillées dans le cadre du Centre d’appui pour la Prévention des Infections Associées aux Soins (CPIAS) de l’Île de France
• elle s’intéresse aux maladies infectieuses émergentes pouvant affecter directement ou indirectement la France comme Ebola, aux maladies à transmission vectorielle comme Zika et Chikungunya, mais également aux infections au retour de voyage avec le Centre National de Référence (CNR) du paludisme
• elle étudie la transmission des pathogènes à l’échelle des réseaux de contact locaux ou régionaux, avec les modèles globaux du projet GLEAM, et la transmission de pathogènes nosocomiaux entre établissements de santé
• elle utilise des modèles de rétrocalcul pour décrire l’épidémiologie de l’infection à VIH à l’aide des données de la cohorte FHDH ANRS C04 et pour quantifier la cascade de prise en charge, depuis l’infection jusqu’au traitement

Ces projets reposent sur des développements méthodologiques transversaux, dans le domaine de l’inférence statistique computationnelle (ML, MCMC, ABC) permettant d’ajuster des modèles complexes aux données d’observation, et sur l’analyse théorique des caractéristiques des réseaux dynamiques supportant la transmission.

Fonctions : Biostatisticien-ne
Emploi-type : Expert-e en information statistique
Catégorie : A
Corps : IGR
BAP : E

CDD de 1 an.

Mission et activités principales :

Sous la direction du responsable de l’équipe SUMO, la personne recrutée aura plusieurs missions décrites ci-dessous :

1) Co-pilotage, avec l’investigateur principal, des travaux scientifiques du WP5 (Data integration; analysis and modelling) du projet SISP&EaU (Surveillance Intégrative en Soins Primaire & des Eaux Usées)

• mise en place d’un référentiel commun pour les données
• obtention d’estimations non biaisées dans la population
• relier la macro-épidémie (eaux usées) à la micro-épidémie (individus)
• développement de modèles de fusion de données à partir de sources multiples
• estimation de la pertinence, de la performance et des coûts des indicateurs

2) Encadrement des travaux de recherche biostatistiques portant sur les thématiques suivantes

• amélioration de l’estimation des incidences
• détection et prévision des épidémies
• rendu cartographique

3) Co-encadrement des travaux statistiques de routine des réseau Sentinelles et Grippenet/Covidnet, en binôme avec le responsable du pôle « Système informatique et biostatistiques » du réseau Sentinelles

• encadrement de l’analyse des données de surveillance épidémiologique des réseaux Sentinelles et Grippenet/Covidnet et participation à leur interprétation
• appui méthodologique et statistique

4) Co-encadrement des travaux statistiques du projet DDI-Vigilance sur les interactions médicamenteuses en médecine de ville en France à partir des données du SNDS, en binôme avec les responsables du réseau Sentinelles

• participation à la définition des objectifs et de la méthodologie à mettre en œuvre
• suivi des analyses et participation à la valorisation scientifique (publications scientifiques, congrès)

5) Accompagnement des autres développements statistiques menés dans l'équipe SUMO

Conduite de projets : Oui

Encadrement : Oui (1 agent de catégorie A)

Formation initiale demandée :

• doctorat en biostatistiques, statistiques/mathématiques appliquées

Connaissance transversales requises :

• en statistiques, en épidémiologie et en santé publique
• maîtrise des méthodes statistiques et des schémas expérimentaux en épidémiologie
• maitrise du logiciel R
• connaissance et expérience d’utilisation de la base de données du SNDS

Savoir-faire :

• capacité d’organisation, de logistique et de travail en équipe
• aisance et goût pour la communication orale et écrite

Savoir être :

• bon relationnel et sens du travail en équipe
• disponibilité et réactivité
• rigueur et curiosité scientifique
• sens du service public
• autonomie et esprit d’initiative