Ingénieur d’étude H/F

Contexte :

La prise de fonction se fera au sein de l’e?quipe BIOM, « BIOdiversity dynamics & Macroecology » du Laboratoire d’Ecologie, Syste?matique et Evolution (UMR CNRS 8079) a? l’Universite? de Paris Saclay. Les projets de ce groupe de recherche sont nombreux et relativement varie?s (invasions biologiques, perception de la biodiversité, réseaux trophiques perturbés, biologie de la conservation, changements climatiques, écologie insulaire, e?cologie des fourmis envahissantes...). Les approches utilise?es sont observationnelles, nume?riques, expe?rimentales et the?oriques et les e?chelles varient de la colonie a? la communaute? et jusqu’a? la macroe?cologie. Cependant, un accent sera mis pour ce poste sur les aspects in silico (base de données, analyse de données).

Le laboratoire a déménagé en Avril 2022 sur le plateau de Saclay, dans un bâtiment tout neuf. L’équipe a été créée suite à l’obtention par l’Université d’une Chaire AXA en 2019, avec engagement de l’université de recruter un tel agent comme soutient pour l’équipe. Ce recrutement correspond à cet engagement.

L’agent sera placé sous la responsabilité directe du responsable de l’équipe BIOM.

Missions principales de l’agent :

Créer, gérer et administrer les systèmes de gestion de données de l’équipes BioM et de leur interface utilisateurs, en assurer la cohérence, la qualité et la sécurité dans des objectifs de partage de données, de respect des principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable & Reusable) et du Règlement Général sur la Protection des Données (RGPD) ; participer à la définition et à la mise en œuvre des bases de données et des progiciels de l’équipe.

La mission la plus ge?ne?rale de l'agent recrute? est de gérer les bases de données de l’équipe et d’en analyser statistiquement les contenus. Ces bases de données concernent les invasions biologiques. Un rôle secondaire est de seconder dans les diffe?rentes facettes de leurs projets les membres de la nouvelle e?quipe créée dans le Labo ESE sous l’impulsion de la Chaire AXA Biologie des Invasions. L'ingénieur.e d'étude (IE) aura donc un ro?le central dans l'e?quipe, comme e?le?ment pe?renne implique? dans des projets assez varie?s. L'IE de?veloppera et conduira les approches me?thodologiques destine?es a? une meilleure compre?hension de la dynamique des populations d'espe?ces concerne?es par la biologie de la conservation et la macroe?cologie. L'IE aura la responsabilite? des moyens techniques et du mate?riel de?die?s aux expe?rimentations et aux analyses.

Activités principales de l’agent :

L’ingénieur.e mettra en place des processus de recueil, de contrôle, d’intégration, de consultation et d’exploitation des données. Il/Elle devra organiser la mise en forme, le stockage et assurer la maintenance des bases de données créées afin de garantir leur pérennité sur le long terme et leur interopérabilité avec d’autres systèmes d’information, dans des objectifs de partage de données, de respect des principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable & Reusable) et du Règlement Général sur la Protection des Données (RGPD). Il/Elle devra également, pour chaque base de données, concevoir et déployer l’application Web et éventuellement créer le site web, afin de permettre différents niveaux d’accès à la base et de sécurité selon les publics visés. Le SI pourra être en lien avec des outils cartographiques et d’autres bases de données en ligne de la communauté, taxonomiques, écologiques, de traits d’histoire de vie, par exemple.

L'agent sera amene? a? :

- interagir e?troitement avec les diffe?rents membres du groupe et notamment les nombreux e?tudiants et stagiaires

- soutenir et former des e?tudiants, participer a? leur encadrement si désiré

Un ro?le actif dans l'animation de l'e?quipe, notamment au travers de l'organisation de re?unions scientifiques re?gulie?res (Journal Clubs, Lab Meetings) sera e?galement un plus.

L'agent pourra e?tre ponctuellement amene? a? :

- intervenir aupre?s du grand public (confe?rences, de?bats)

- repre?senter l'e?quipe lors de re?unions scientifiques (pre?sentations orales ou affiche?es lors de congre?s)

Connaissance, savoir :

• Mai?trise et appropriation des concepts fondamentaux lie?s aux diffe?rents projets, tels que pre?sente?s sur le site Internet de l'e?quipe : https://www.biodiversitydynamics.fr/ Il s'agit principalement des concepts utilise?s en dynamique des relations trophiques, en macroe?cologie, en conservation de la biodiversite? et en myrme?cologie.
• Connaissances générales en sciences de la vie et de la terre avec idéalement une spécialisation en écologie
• Connaître les dispositifs de mesure en sciences écologiques et environnementales
• Maîtriser les outils et concepts de base de données relationnelles, les méthodes et techniques de programmation, certains langages (R a minima, mais potentiellement d’autres parmi PYTHON, PHP, HTML, CSS, SQL, etc), les bases de données : PostGreSQL, MySQL, etc.
• Maîtriser les techniques d’analyses statistique uni et multivariées, voire non bayésiennes

Savoir-faire :

La personne recrute?e devra e?galement mai?triser les aspects techniques lie?s aux diffe?rentes approches utilise?es dans l'e?quipe, et notamment :

• Posse?der d'excellentes bases en statistique et mode?lisation
• Mai?triser la conception et l'analyse des bases de donne?es
• Mai?triser le recueil de bases données (data-mining)
• Maîtriser le codage sous R, a minima
• Capacite? de travail en e?quipe indispensable
• Mai?trise indispensable de l'anglais courant (et du Français si possible)
• Capacite?/volonté a? encadrer
• Mai?trise des techniques d'animation et conduite de re?unions
• Être capable de former des stagiaires et étudiants et de suivre des formations soi-même

Savoir-être :

• Être motivé, positif, voire enthousiaste
• Être consciencieux, rigoureux, voire perfectionniste
• Être travailleur
• Être curieux, ouvert d'esprit
• Être capable de s'adapter à des situations variées
• Être capable d'organiser au mieux son temps pour répondre aux objectifs